MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 68571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021081	GCT	2	6	268622	268627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881908
6002	NC_021081	CAC	2	6	268634	268639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881908
6003	NC_021081	GCCACC	2	12	268665	268676	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	482881908
6004	NC_021081	CAC	2	6	268703	268708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881908
6005	NC_021081	TTG	2	6	268710	268715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881908
6006	NC_021081	TGG	2	6	268723	268728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881908
6007	NC_021081	GAA	2	6	268775	268780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881908
6008	NC_021081	GCA	2	6	268819	268824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881908
6009	NC_021081	GGT	2	6	268835	268840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881908
6010	NC_021081	GGT	2	6	268850	268855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881908
6011	NC_021081	GGCCG	2	10	268876	268885	0 %	0 %	60 %	40 %	482881908
6012	NC_021081	GGT	2	6	269009	269014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881908
6013	NC_021081	CCA	2	6	269035	269040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881908
6014	NC_021081	CTC	2	6	269051	269056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881908
6015	NC_021081	CAC	2	6	269129	269134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881908
6016	NC_021081	CAA	2	6	269231	269236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881908
6017	NC_021081	GCC	2	6	269374	269379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881909
6018	NC_021081	GTT	2	6	269392	269397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881909
6019	NC_021081	ACC	2	6	269418	269423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881909
6020	NC_021081	ATG	2	6	269427	269432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881909
6021	NC_021081	CCCCCT	2	12	269503	269514	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	482881909
6022	NC_021081	CGGG	2	8	269567	269574	0 %	0 %	75 %	25 %	482881909
6023	NC_021081	GGCC	2	8	269611	269618	0 %	0 %	50 %	50 %	482881909
6024	NC_021081	AG	3	6	269625	269630	50 %	0 %	50 %	0 %	482881909
6025	NC_021081	AGCACC	2	12	269742	269753	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	482881909
6026	NC_021081	GGTC	2	8	269761	269768	0 %	25 %	50 %	25 %	482881909
6027	NC_021081	GGC	2	6	269777	269782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881909
6028	NC_021081	GCCAGG	2	12	269868	269879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482881909
6029	NC_021081	GGC	2	6	269883	269888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881909
6030	NC_021081	T	6	6	269951	269956	0 %	100 %	0 %	0 %	482881909
6031	NC_021081	CAG	2	6	269963	269968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881909
6032	NC_021081	TGA	2	6	269998	270003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881909
6033	NC_021081	CCTT	2	8	270060	270067	0 %	50 %	0 %	50 %	482881909
6034	NC_021081	GCG	2	6	270178	270183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881909
6035	NC_021081	GC	3	6	270232	270237	0 %	0 %	50 %	50 %	482881909
6036	NC_021081	AGT	2	6	270253	270258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881909
6037	NC_021081	AGC	2	6	270261	270266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881909
6038	NC_021081	CAC	2	6	270308	270313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881909
6039	NC_021081	AC	3	6	270367	270372	50 %	0 %	0 %	50 %	482881909
6040	NC_021081	CTACCT	2	12	270403	270414	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	482881909
6041	NC_021081	AGCC	2	8	270449	270456	25 %	0 %	25 %	50 %	482881909
6042	NC_021081	G	6	6	270479	270484	0 %	0 %	100 %	0 %	482881909
6043	NC_021081	AAG	2	6	270504	270509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881909
6044	NC_021081	CA	3	6	270512	270517	50 %	0 %	0 %	50 %	482881909
6045	NC_021081	AGG	2	6	270524	270529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021081	CTGG	2	8	270566	270573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_021081	TGG	2	6	270577	270582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_021081	TG	3	6	270587	270592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021081	GC	3	6	270596	270601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_021081	AT	3	6	270629	270634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_021081	GTAGT	2	10	270652	270661	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021081	T	6	6	270684	270689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021081	TAG	2	6	270890	270895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881910
6054	NC_021081	TCAG	2	8	270938	270945	25 %	25 %	25 %	25 %	482881910
6055	NC_021081	GCTG	2	8	270954	270961	0 %	25 %	50 %	25 %	482881910
6056	NC_021081	TGG	2	6	270981	270986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881910
6057	NC_021081	TGT	2	6	270987	270992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881910
6058	NC_021081	GTT	2	6	271003	271008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881910
6059	NC_021081	GTT	2	6	271030	271035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881910
6060	NC_021081	TGT	2	6	271071	271076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881910
6061	NC_021081	CCA	2	6	271139	271144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881910
6062	NC_021081	AG	3	6	271159	271164	50 %	0 %	50 %	0 %	482881910
6063	NC_021081	TCA	2	6	271173	271178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881910
6064	NC_021081	GGC	2	6	271189	271194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881910
6065	NC_021081	ATA	2	6	271232	271237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881910
6066	NC_021081	AAT	2	6	271246	271251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881910
6067	NC_021081	GCTG	2	8	271362	271369	0 %	25 %	50 %	25 %	482881910
6068	NC_021081	CCG	2	6	271385	271390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881910
6069	NC_021081	AAG	2	6	271433	271438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881910
6070	NC_021081	TAA	2	6	271458	271463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482881910
6071	NC_021081	TGG	2	6	271473	271478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881910
6072	NC_021081	CGA	2	6	271497	271502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881910
6073	NC_021081	GCTG	2	8	271596	271603	0 %	25 %	50 %	25 %	482881910
6074	NC_021081	CGT	2	6	271728	271733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881910
6075	NC_021081	TGC	2	6	271740	271745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881910
6076	NC_021081	GTA	2	6	271759	271764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881910
6077	NC_021081	AC	3	6	271788	271793	50 %	0 %	0 %	50 %	482881910
6078	NC_021081	TCTGG	2	10	271805	271814	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6079	NC_021081	GCAA	2	8	271853	271860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6080	NC_021081	AAC	2	6	271861	271866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_021081	GGT	2	6	271907	271912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_021081	CAC	2	6	271948	271953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_021081	ATT	2	6	271958	271963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_021081	GAGT	2	8	271964	271971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_021081	TGG	2	6	272033	272038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_021081	AAC	2	6	272103	272108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881911
6087	NC_021081	CAGC	2	8	272119	272126	25 %	0 %	25 %	50 %	482881911
6088	NC_021081	AGC	2	6	272139	272144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881911
6089	NC_021081	AGC	2	6	272156	272161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881911
6090	NC_021081	AGCG	2	8	272256	272263	25 %	0 %	50 %	25 %	482881911
6091	NC_021081	AGC	2	6	272330	272335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881911
6092	NC_021081	CTT	2	6	272416	272421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881911
6093	NC_021081	GCG	2	6	272468	272473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881911
6094	NC_021081	GCGGCT	2	12	272646	272657	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_021081	GC	3	6	272674	272679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_021081	TAG	2	6	272683	272688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_021081	GGCTG	2	10	272703	272712	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6098	NC_021081	ACC	2	6	272772	272777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6099	NC_021081	CAG	2	6	273182	273187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881912
6100	NC_021081	TA	4	8	273239	273246	50 %	50 %	0 %	0 %	482881912
6101	NC_021081	TGG	2	6	273264	273269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881912
6102	NC_021081	TGA	2	6	273304	273309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881912
6103	NC_021081	AGA	2	6	273347	273352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881912
6104	NC_021081	GGCTTG	2	12	273393	273404	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	482881912
6105	NC_021081	CTG	2	6	273408	273413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881912
6106	NC_021081	T	6	6	273424	273429	0 %	100 %	0 %	0 %	482881912
6107	NC_021081	T	6	6	273432	273437	0 %	100 %	0 %	0 %	482881912
6108	NC_021081	TGG	2	6	273493	273498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881912
6109	NC_021081	GGCT	2	8	273505	273512	0 %	25 %	50 %	25 %	482881912
6110	NC_021081	GCT	2	6	273632	273637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881912
6111	NC_021081	G	6	6	273686	273691	0 %	0 %	100 %	0 %	482881912
6112	NC_021081	TTG	2	6	273711	273716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881912
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6115	NC_021081	TTG	2	6	273843	273848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881912
6116	NC_021081	T	6	6	273854	273859	0 %	100 %	0 %	0 %	482881912
6117	NC_021081	TGC	3	9	273863	273871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881912
6118	NC_021081	ACC	2	6	273903	273908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881912
6119	NC_021081	TGG	2	6	273922	273927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881912
6120	NC_021081	T	8	8	273946	273953	0 %	100 %	0 %	0 %	482881912
6121	NC_021081	CCA	2	6	274012	274017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881912
6122	NC_021081	TTGT	2	8	274053	274060	0 %	75 %	25 %	0 %	482881912
6123	NC_021081	TACT	2	8	274140	274147	25 %	50 %	0 %	25 %	482881912
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6125	NC_021081	GCA	2	6	274199	274204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881912
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6369	NC_021081	GCCA	2	8	286059	286066	25 %	0 %	25 %	50 %	482881919
6370	NC_021081	G	6	6	286118	286123	0 %	0 %	100 %	0 %	482881919
6371	NC_021081	GTG	2	6	286141	286146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881919
6372	NC_021081	GCT	2	6	286278	286283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881920
6373	NC_021081	CTG	2	6	286356	286361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881920
6374	NC_021081	TGG	2	6	286385	286390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881920
6375	NC_021081	TGT	2	6	286391	286396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482881920
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6391	NC_021081	CGT	2	6	287132	287137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881920
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6398	NC_021081	TGGCGC	2	12	287267	287278	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482881920
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6400	NC_021081	TCG	2	6	287434	287439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6401	NC_021081	CTCTG	2	10	287451	287460	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6402	NC_021081	TTA	2	6	287573	287578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6403	NC_021081	GAA	2	6	287595	287600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6404	NC_021081	GAG	2	6	287657	287662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6406	NC_021081	A	7	7	287749	287755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6441	NC_021081	TTC	2	6	289219	289224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881923
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6447	NC_021081	A	6	6	289603	289608	100 %	0 %	0 %	0 %	482881923
6448	NC_021081	TCG	2	6	289610	289615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881923
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6450	NC_021081	TTC	2	6	289678	289683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881923
6451	NC_021081	GTA	2	6	289702	289707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881923
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6471	NC_021081	TGTACT	2	12	290467	290478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482881924
6472	NC_021081	CCT	2	6	290494	290499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881924
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6475	NC_021081	CGCC	2	8	290614	290621	0 %	0 %	25 %	75 %	482881924
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6477	NC_021081	CCT	2	6	290661	290666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6478	NC_021081	CTTGC	2	10	290677	290686	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6479	NC_021081	CACC	2	8	290720	290727	25 %	0 %	0 %	75 %	482881925
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6483	NC_021081	GCTG	2	8	290832	290839	0 %	25 %	50 %	25 %	482881925
6484	NC_021081	CGGCC	2	10	290840	290849	0 %	0 %	40 %	60 %	482881925
6485	NC_021081	C	6	6	290848	290853	0 %	0 %	0 %	100 %	482881925
6486	NC_021081	ACC	3	9	290854	290862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881925
6487	NC_021081	CCG	2	6	290921	290926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881925
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6489	NC_021081	CCGGC	2	10	291016	291025	0 %	0 %	40 %	60 %	482881925
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